Lorsque les trois grands partis – social-démocrates, chrétiens-sociaux et grands-allemands – entreprirent d’instaurer la République après l’effondrement de l’empire des Habsbourg en 1918, Seitz fut élu l’un des trois présidents de l’Assemblée nationale provisoire. Le 3 mars 1919, l’Assemblée nationale constituante l’a élu Premier président, devenant ainsi le premier chef d’État de la nouvelle République (jusqu’en décembre 1920). Seitz, qui avait également pris la tête du Parti après la mort de Victor Adler le 11 novembre 1918, a siégé au Conseil national jusqu’en 1934.

Après la démission de Jakob Reumann pour raison d’âge, Seitz devient maire de Vienne en 1923 et se trouve pendant plus de dix ans à la tête de la grande oeuvre de construction communale (construction de logements, système scolaire, réformes sociales).

Le 12 février 1934, Seitz est arrêté dans son bureau de l’hôtel de ville et reste en prison jusqu’à la fin de l’année sans être inculpé. Il refuse cependant de quitter l’Autriche, même après l’"Anschluss" avec l’Allemagne en 1938. Lorsque, après l’attentat manqué contre Hitler le 20 juillet 1944, on trouve des documents qui incriminent également Seitz, il est à nouveau arrêté et envoyé au camp de concentration de Ravensbrück. Après la libération du camp, il arrive à Vienne en juin 1945. De la fin 1945 jusqu’à sa mort en 1950, Seitz fait à nouveau partie du Conseil national.